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Las áreas científicas del CIBER-BBN son: Bioingeniería e imagen biomédica, Biomateriales e ingeniería tisular y Nanomedicina, estando la investigación del Centro orientada tanto al desarrollo de sistemas de prevención, diagnóstico y seguimiento como a tecnologías relacionadas con terapias específicas como Medicina Regenerativa y las Nanoterapias.
Los objetivos globales planteados en el plan científico del CIBER-BBN incluyen el incremento de las capacidades de investigación de los grupos componentes mediante el uso compartido de recursos, la coordinación y el fomento de sinergias. Se potenciará un mayor y mejor uso de las tecnologías avanzadas en el Sistema Nacional de Salud, constituyéndose de forma progresiva en la referencia nacional en estas tecnologías. De forma simultánea se aumentará la presencia española en los foros de decisión y redes de investigación internacionales en su ámbito. Conjuntamente, se ha propuesto mejorar el nivel tecnológico de la industria nacional en este sector y favorecer la aparición de especialistas con un alto nivel de formación en tecnologías para la salud.
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